Se a tela avisar que você vai assinar em nome da empresa e mostrar um CNPJ, quem enviou o documento pediu a assinatura da empresa, não a sua como pessoa física.
O que você precisa
O certificado e-CNPJ daquela empresa, no formato A1 — aquele que é um arquivo terminado em .pfx ou .p12 — e a senha dele.
O seu certificado pessoal (e-CPF) não serve neste convite. Não é um problema do seu certificado: o documento pede especificamente a assinatura da empresa.
Você continua sendo identificado
Dentro do certificado da empresa existe o CPF da pessoa responsável por ele. Conferimos esse CPF com o do convite — ou seja, além de a empresa ter de ser a correta, quem assina tem de ser você. O comprovante do documento registra os dois: a empresa (CNPJ) e você.
Mensagens que podem aparecer
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"Este convite pede assinatura em nome da empresa" — você enviou o seu certificado pessoal. Envie o e-CNPJ da empresa.
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"Este certificado é de outra empresa" — o CNPJ do certificado não é o que está no convite. Confira se pegou o arquivo certo.
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"O responsável por este certificado não é o signatário convidado" — o certificado é da empresa certa, mas está no nome de outra pessoa. Quem assina precisa ser a pessoa do convite.
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"O certificado da empresa não informa o CPF do responsável" — esse certificado não traz os dados de quem responde por ele. Fale com quem enviou o documento.
E se você não tem o certificado da empresa?
Responda o e-mail de quem enviou o documento e explique. A pessoa pode reenviar o convite sem o CNPJ — aí você assina normalmente como pessoa física, com o seu e-CPF, ou pelas opções Simples/Avançada, se o documento permitir.
Só o certificado A1 (arquivo) funciona. Certificado em cartão ou token (tipo A3) ainda não pode ser usado aqui — veja tipos de assinatura.